Exoma Completo | Análise de CNVs + DNA Mitocondrial

CURIOSIDADES SOBRE DOENÇAS RARAS E GENÉTICAS

• No Brasil, são consideradas doenças raras aquelas que afetam até 65 pessoas a cada 100 mil. O número de portadores de doenças raras no país é estimado em 13 milhões, sendo que cerca de 80% das doenças raras tem causa genética.
• O tempo médio para se chegar a um diagnóstico de doença rara ou genética é de 5 a 7 anos e os principais motivos que contribuem para essa demora, conhecida no meio médico como "odisseia diagnóstica, se deve a manifestação de sintomas parecidos com outras doenças "comuns" e poucos profissionais com especialização em genética médica. Por isso, defendemos tanto aqui na TestYou que o diagnóstico precoce salva vidas e muda rotas.

POR QUE ESTE EXAME É TÃO IMPORTANTE?

• O sequenciamento completo do Exoma é extremamente importante para identificar doenças genéticas raras e quadros complexos, como malformações, atraso do dosenvolvimento, deficiência intelectual, dentre outros.
• Com o diagnóstico correto, é possível direcionar terapias mais assertivas e medicamentos específicos para cada condição, aumentando a eficácia do tratamento.
• Ajuda a avaliar de forma mais precisa, o risco quanto ao desenvolvimento de certas condições e a probabilidade de recorrência em futuras gestações ou em outros parentes.

BENEFÍCIOS AO REALIZAR ESTE EXAME

• Maiores chances de diagnóstico em quadros complexos: Indicado para doenças raras, malformações, atraso do desenvolvimento, autismo, epilepsia e casos sem diagnóstico definido, aumentando a probabilidade de identificar a causa genética e sair da investigação fragmentada.
• Informação que muda conduta: Resultados que podem direcionar terapias específicas, vigilância clínica, definição de prognóstico, aconselhamento genético e planejamento reprodutivo (incluindo riscos de recorrência para a família).
• Exoma + DNA mitocondrial em um único exame: Avalia simultaneamente o DNA nuclear (todos os éxons) e o genoma mitocondrial, cobrindo um amplo espectro de doenças genéticas.
• Achados secundários relevantes: Possibilidade de identificar variantes patogênicas em genes recomendados pelo ACMG, com impacto em prevenção de doenças de início adulto, sempre com aconselhamento genético recomendado.

A QUEM ESTE EXAME É INDICADO E QUANDO DEVE SER FEITO?

• Doenças raras e quadros sindrômicos complexos: Pacientes com múltiplas malformações, comprometimento de vários sistemas ou suspeita forte de condição genética, sem gene específico claramente suspeito.
• Atraso global do desenvolvimento, deficiência intelectual e autismo: Crianças ou adultos com atraso motor e/ou cognitivo, dificuldade de aprendizado, TEA e outros transtornos do neurodesenvolvimento, principalmente quando há histórico familiar ou outros sinais associados (dismorfias, convulsões, etc.).
• Epilepsias de difícil controle ou de início precoce
  - Gestantes com achados ultrassonográficos fetais sugestivos de síndrome genética.
• Casos sem diagnóstico definido após investigação inicial: Quando exames bioquímicos, de imagem, painéis menores ou cariótipo / microarray não foram conclusivos; o Exoma Completo + DNA mitocondrial entra como próximo passo lógico e abrangente.
• Situações em que existe dúvida entre múltiplas hipóteses genéticas: Ao invés de testar gene a gene ou painel a painel, o Exoma permite investigar simultaneamente várias possibilidades.

TIPO DE AMOSTRA
Saliva (Autocoleta - no conforto de sua casa)

Relacionamos abaixo, as respostas para algumas das perguntas que mais são feitas sobre esse exame:

• Já fizemos muitos exames e nunca acharam nada. Por que esse seria diferente? Porque o Sequenciamento Completo do Exoma com DNA mitocondrial olha praticamente todo o conjunto de genes codificadores e o genoma mitocondrial de uma vez, em vez de investigar um gene ou um painel pequeno de cada vez. Isso aumenta muito a chance de encontrar a causa genética de quadros complexos ou atípicos, como doenças raras, malformações fetais e atraso do desenvolvimento.
• Não é exagero começar logo com um exame tão grande e complexo? Em muitos casos, especialmente quando há malformações importantes, atraso global, autismo, epilepsia de difícil controle ou suspeita de doença rara, diretrizes internacionais já consideram o Exoma (com ou sem genoma mitocondrial) exame de primeira linha. Em vez de gastar tempo e recursos em muitos testes isolados, um exame abrangente encurta a investigação e pode ser mais custo efetivo no conjunto da investigação.
• E se vier ‘normal’? Não vou ter jogado dinheiro fora? Um Exoma “sem variante patogênica relacionada ao quadro” ainda é muito valioso: 1. afasta um grande número de doenças genéticas já conhecidas; 2. ajuda o médico a redirecionar a investigação (metabólica, infecciosa, autoimune etc.); 3. gera um banco de dados genético que pode ser reavaliado no futuro, conforme novas descobertas científicas. 4. Ou seja, mesmo sem um achado definitivo, o exame organiza e afunila as próximas etapas.
• Exame genético é assustador, tenho medo de descobrir coisas que não quero saber. O exame é focado, primeiro, em explicar o quadro atual. Achados secundários (aqueles não relacionados ao problema principal) são reportados seguindo recomendações internacionais (ACMG), sempre com a orientação de aconselhamento genético. É possível alinhar com o médico quais tipos de achados são de interesse, para garantir que a informação seja útil e manejável para a família.
  - Isso vai mudar algo no tratamento ou é só para ‘dar nome’ à doença? O ponto central e inicial aqui seria trazer clareza à situação e direcionar o cuidado e além disso, identificar a causa genética pode: 1. indicar terapias específicas ou evitar medicamentos contraindicados; 2. definir necessidade de rastreamentos regulares (cardíaco, oncológico, neurológico etc.); 3. orientar terapias de reabilitação mais adequadas; 4. permitir aconselhamento genético e planejamento reprodutivo para futuros filhos.
• É muito complexo, não vou entender o laudo. O laudo é feito para ser interpretado pelo médico, mas traz explicações claras sobre: 1. qual gene foi identificado; 2. qual condição está associada; 3. qual o padrão de herança; 4. que impacto isso tem para o paciente e para a família. Além disso, em nosso produto já está sendo incluso, sem qualquer custo adicional, uma consulta inicial e outra pós laudo com um médico geneticista para esclarecer qualquer dúvida e/ou orientar em relação aos próximos passos, transformando o resultado em informações compreensíveis e decisões práticas.
• Qual é a diferença entre esse exame e um painel genético específico? Um painel específico avalia apenas um grupo limitado de genes pré selecionados (por exemplo, só epilepsia, só cardiopatias). O Exoma Completo com DNA mitocondrial não se limita a um grupo: ele analisa todos os genes codificadores e o genoma mitocondrial, permitindo: 1. encontrar causas em genes ainda não suspeitos; 2. reaproveitar o exame no futuro, caso surjam novos genes associados à doença. 3. Isso é especialmente importante em quadros complexos ou atípicos, em que não está claro qual painel usar.
• A coleta é complicada? Precisa de biópsia ou internação? De forma alguma, muito pelo contrário. A coleta deste exame é realizada de forma indolor, segura e prática, com uma pequena amostra de saliva, obtida através de um SWAB Bucal.
• Tenho receio com privacidade e uso dos dados genéticos. Os dados são tratados sob rigorosos padrões de sigilo e proteção. A análise se restringe às regiões necessárias para o exame, e o acesso ao arquivo de variantes (.vcf) e ao laudo é controlado. Não há compartilhamento com terceiros sem autorização formal. Além disso, recomendações de uso, armazenamento e possível reanálise no futuro seguem normas éticas e regulatórias de genética médica.

• Técnica utilizada: Sequenciamento de Nova Geração (NGS)
• Quantidade de genes analisados: +20.000 genes
• Outras análises inclusas: Detecção de SNVs, INDELS, CNVs e DNA Mitocondrial.
• Amostra coletada: Cotonete passado na parte interna da bochecha (SWAB Bucal)
• Preparo: Não há necessidade de jejum ou qualquer outro preparo específico. Orientamos apenas que o paciente permaneça por 1 hora sem consumir nenhum alimento e nenhuma bebida.
• Exoma + DNA mitocondrial em um único exame: Avalia simultaneamente o DNA nuclear (todos os éxons) e o genoma mitocondrial, cobrindo um amplo espectro de doenças genéticas.
• Maiores chances de diagnóstico em quadros complexos: Indicado para doenças raras, malformações, atraso do desenvolvimento, autismo, epilepsia e casos sem diagnóstico definido, aumentando a probabilidade de identificar a causa genética e sair da investigação fragmentada.
• Tecnologia robusta e alta cobertura: Sequenciamento em plataforma Illumina, com cobertura >99% das regiões-alvo do DNA nuclear ≥30x e 100% do mtDNA ≥500x, análise de SNV/indels e CNVs, seguindo critérios do American College of Medical Genetics and Genomis (ACMG/ClinGen).
• Informação que muda conduta: Resultados que podem direcionar terapias específicas, vigilância clínica, definição de prognóstico, aconselhamento genético e planejamento reprodutivo (incluindo riscos de recorrência para a família).
• Achados secundários relevantes: Possibilidade de identificar variantes patogênicas em genes recomendados pelo ACMG, com impacto em prevenção de doenças de início adulto, sempre com aconselhamento genético recomendado.
• Limitações do exame: Destacamos abaixo as principais limitações deste exame.

1. Este exame não avalia regiões não codificantes do genoma, não sendo indicado para a investigação de condições associadas a expansões de polinucleotídeos ou para a detecção de eventos
genéticos complexos, tais como inversões, translocações e expansões repetitivas.

2. A ausência de detecção não exclui a possibilidade de que a variante esteja presente em outros tecidos ou em diferentes proporções de heteroplasmia.

3. O limite de detecção (LoD) para variantes mitocondriais é de 5% de heteroplasmia em regiões com cobertura mínima de 200x.

4. Este exame apresenta sensibilidade superior a 99% para detecção de variantes do tipo SNV e pequenas inserções / deleções de até 20 pb. Alterações maiores que 20 pb e menores que um éxon podem ser detectadas com sensibilidade reduzida. A análise de CNVs que envolvem um ou mais éxons apresenta sensibilidade superior a 90%.